Иногородним детям предоставляется комфортабельное общежитие. Контингент учащихся лицея формируется путем конкурсного набора. Что касается профилизации лицея, то это естественно-математические предметы: биология, химия, физика, математика, информатика. Для одаренных детей в учреждении создана конкурентная развивающая среда, включающая тесный контакт университетского и школьного образования, компактное проживание, продуктивное общение в научной среде и участие в исследовательских разработках. Ежегодно Губернский лицей попадает в список 500 лучших школ России и топы общеобразовательных организаций физико-математического, химико-биологического, индустриально-технологического профилей. В 2018 году одна из учениц лицея стала победителем, а четверо — призерами заключительного этапа Всероссийской олимпиады школьников. На базе Губернского лицея-интерната для одаренных детей в 2009 году в рамках федеральной целевой программы был создан Центр дистанционного образования детей-инвалидов Пензенской области.
Обучение в ЦДО ведется по общеобразовательным программам (с 1-го по 11-й класс) и по программам дополнительного образования (как для учащихся ЦДО, так и для детей-инвалидов других общеобразовательных учреждений). Все дети обеспечиваются полным комплектом компьютерного оборудования, необходимого для дистанционного обучения, подключается бесплатная линия Интернет. В Центре проводятся различные мероприятия для учащихся в очной, дистанционной и очно-дистанционной форме. Проводятся занятия с психологом, логопедом, сурдопедагогом, тифлопедагогом, дефектологом. Главная задача Центра — дать возможность детям с особыми потребностями получить качественное образование и занять достойное место в жизни.
